Curso de movilización de datos sobre biodiversidad

Documentación clave

Las siguientes referencias proporcionan más detalles sobre los temas cubiertos en este curso. Todos los enlaces se abren en una ventana/pestaña nueva.

Darwin Core

Publicación de datos

Guía rápida para publicar datos a través de GBIF
How to publish biodiversity data through GBIF.org
Conviértete en un publicador de datos con GBIF
Buenas prácticas para la publicación de datos sobre biodiversidad derivados de evaluaciones de impacto ambiental.
Secretaría de GBIF & IAIA: Asociación Internacional para la Evaluación de Impactos (2020).
Guidance for private companies to become data publishers through GBIF: Template document to support the internal authorization process to become a GBIF publisher
Rui Figueira, Pedro Beja, Cristina Villaverde, Miguel Vega, Katia Cezón, Tainan Messina, Anne-Sophie Archambeau, Rukaya Johaadien, Dag Endresen & Dairo Escobar (2020).
Publishing DNA-derived data through biodiversity data platforms
Anders F. Andersson, Andrew Bissett, Anders G. Finstad, Frode Fossøy, Marie Grosjean, Michael Hope, Thomas S. Jeppesen, Urmas Kõljalg, Daniel Lundin, R. Henrik Nilsson, Maria Prager, Cecilie Svenningsen & Dmitry Schigel (2020).
Tipos de conjuntos de datos soportados por GBIF
GBIF data quality requirements for publishing
GBIF data licenses
Checklist core templates
Ocurrence core templates
Sampling event core templates
Sampling event data best practices
Compartiendo imágenes, sonidos y videos en GBIF
Artículos de datos
Artículos de datos publicados

Publicación de datos: IPT

Digitalización

GBIF

Qué es GBIF
Plan estratégico
Hágase miembro
Science Review
Establishing an Effective GBIF Participant Node: Concepts and general considerations
GBIF Secretariat (2019).

Georreferenciación

Georeferencing Best Practices
Arthur D. Chapman & John R. Wieczorek (2020).
Georeferencing Quick Reference Guide
Paula F. Zermoglio, Arthur D. Chapman, John R. Wieczorek, Maria Celeste Luna & David A. Bloom (2020).
Georeferencing Calculator Manual
David A. Bloom, John R. Wieczorek & Paula F. Zermoglio (2020).
Georeferencing resources

Especies invasoras

Living Atlases

Misceláneos

OpenRefine

OpenRefine documentation
OpenRefine regular expressions
Guía para la limpieza de datos sobre biodiversidad con OpenRefine
Paula F. Zermoglio, Camila A. Plata Corredor, John R. Wieczorek, Ricardo Ortiz Gallego & Leonardo Buitrago (2021).
Using Google Refine and taxonomic databases (EOL, NCBI, uBio, WORMS) to clean messy data
iPhylo blog post. Rod Page 2012.
Reconciling author names using Open Refine and VIAF
iPhylo blog post. Rod Page 2013.
Validating scientific names with the GBIF Portal web service API
Guest post was written by Gaurav Vaidya, Victoria Tersigni and Robert Guralnick 2013.
iDigBio Cleaning data with OpenRefine
iDigBio 2013.
Have We Got the Names “Right”?
Canadensys 2014.
Cleaning data with OpenRefine
Desmet and Brosens 2016 TDWG.
EasyOpen Redlist
Querying the IUCN Red List, using a species list, OpenRefine, and some pre-written code. Olly Griffin July 2019.

Planificación/Colaboración

Calidad

Principles of Data Quality
Arthur Chapman 2005.
Principles and Methods of Data Cleaning: Primary Species and Species-Occurrence Data
Arthur Chapman 2005.
Be careful with dates in Excel
DataOne 2014.
Character encoding for beginners
MVZ Guide for Recording Localities in Field Notes

Especies sensibles

Current Best Practices for Generalizing Sensitive Species Occurrence Data
Arthur D. Chapman 2020.

Taxonomía