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| Les références suivantes fournissent plus de détails sur les sujets abordés dans ce cours. Tous les liens s’ouvrent dans une nouvelle fenêtre/onglet. |
Publication de données
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Comment publier des données sur la biodiversité via GBIF.org
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Bonnes pratiques pour publier des données sur la biodiversité à partir des études d’impact environnemental + Secrétariat du GBIF et IAIA : Association internationale pour l’évaluation des impacts (2020).
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Guide à destination des entreprises privées pour devenir éditeurs de données via le GBIF : modèle de document pour appuyer le processus de validation interne afin de devenir un éditeur de données GBIF + Rui Figueira, Pedro Beja, Cristina Villaverde, Miguel Vega, Katia Cezón, Tainan Messina, Anne-Sophie Archambeau, Rukaya Johaadien, Dag Endresen & Dairo Escobar (2020).
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Publier des données dérivées de séquences génétiques via des plateformes de données sur la biodiversité + Anders F. Andersson, Andrew Bissett, Anders G. Finstad, Frode Fossøy, Marie Grosjean, Michael Hope, Thomas S. Jeppesen, Urmas Kõljalg, Daniel Lundin, R. Henrik Nilsson, Maria Prager, Cecilie Svenningsen & Dmitry Schigel (2020).
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Pré-requis GBIF sur la qualité des données pour la publication
Publication de données : IPT
Géoréférencement
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Meilleures pratiques de Géoréférencement + Arthur D. Chapman & John R. Wieczorek (2020).
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Guide de référence rapide du Géoréférencement + Paula F. Zermoglio, Arthur D. Chapman, John R. Wieczorek, Maria Celeste Luna & David A. Bloom (2020).
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Manuel du calculateur de géoréférencement + David A. Bloom, John R. Wieczorek & Paula F. Zermoglio (2020).
OpenRefine
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Guide de nettoyage des données de biodiversité avec OpenRefine + Paula F. Zermoglio, Camila A. Plata Corredor, John R. Wieczorek, Ricardo Ortiz Gallego & Leonardo Buitrago (2021).
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Utiliser Google Refine et des bases de données taxonomiques (EOL, NCBI, uBio, WORMS) pour nettoyer les données désordonnées + iPhylo blog post. Rod Page 2012.
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Réconcilier les noms des auteurs en utilisant Open Refine et VIAF + article de blog iPhylo. Rod Page 2013.
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Valider les noms scientifiques avec l’API du portail GBIF + Le message d’invité a été rédigé par Gaurav Vaidya, Victoria Tersigni et Robert Guralnick 2013.
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Nettoyage des données iDigBio avec OpenRefine + iDigBio 2013.
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Avons-nous les noms « Corrects »? + Canadensys 2014.
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Nettoyage des données avec OpenRefine + Desmet et Brosens 2016 TDWG.
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Liste rouge EasyOpen + Interrogation de la liste rouge de l’UICN, en utilisant une liste d’espèces, OpenRefine, et un code pré-écrit. Olly Griffin Juillet 2019.
Qualité
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Principes de la qualité des données + Arthur Chapman 2005.
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Principes et méthodes de nettoyage des données: Espèces primaires et Données d’Occurrence des espéces + Arthur Chapman 2005.
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Soyez prudent avec les dates dans Excel + DataOne 2014.
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Guide MVZ d’enregistrement des localités dans les notes de terrain
Espèces sensibles
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Pratiques exemplaires actuelles pour la généralisation des espèces sensibles + Arthur D. Chapman 2020.