Cours de mobilisation des données sur la biodiversité

occurrence
La plupart du temps, les spécimens de bases de données de collection sont partagés en tant que données d’occurrence. Chaque occurrence (spécimen ou groupe de spécimens) a son propre identifiant unique (parfois dérivé de son numéro de catalogue dans la collection source) et les champs Darwin Core utilisés pour les partager au sein du GBIF décrivent chaque spécimen : nom scientifique, la date à laquelle il a été recueillie sur le terrain, qui l’a collecté et/ou identifié, où, etc. Chaque collection peut avoir plus d’un spécimen d’une même espèce, à condition que chaque spécimen soit identifié par une identification unique.

liste de contrôle
Il est également possible de créer et de partager une liste de contrôle taxonomique dérivée d’une base de données de collection ; dans ce cas, il est recommandé de partager la liste de contrôle en tant qu’ensemble de données taxonomiques, avec la liste des occurrences (spécimens) associées à elle en utilisant le noyau Occurrence comme extension du noyau taxon sur l’IPT du GBIF.

occurrence
Certains éditeurs de données partageront des ensembles de données d’occurrence provenant d’études ou de programmes de suivi de spécimens provenant de certaines espèces envahissantes spécifiques ; lorsque les données se concentrent sur les individus au lieu de l’espèce envahissante, en général, elles peuvent être partagées en tant que données d’occurrence.

la liste de contrôle
Les espèces invasives peuvent être suivies et surveillées à différentes échelles (régionales, nationales, thématiques…); car ce type de jeu de données se concentre davantage sur les espèces et leur distribution sur une portée géographique donnée, ils sont principalement partagés en tant que jeux de données taxonomiques au sein du GBIF (https://www. bif.org/dataset/search?project_id=GRIIS[ voir les résultats de recherche GRIIS]).

occurrences
Les données sont enregistrées par des naturalistes sur le terrain et peuvent être partagées en tant que simples jeux de données d’Occurrence.

événement d’échantillonnage
Ils peuvent également être partagés en tant que jeux de données d’événements si des protocoles normalisés (comme des plots de végétation, les transectes, les pièges…) sont utilisés pour collecter les données.

occurrence
Ces données sont partagées comme des jeux de données d’occurrences : idéalement, chaque oiseau est identifié avec son organisme et chaque occurrence (GPS ping) a son propre ID d’occurrence, qui est utile pour suivre les différents emplacements GPS du même oiseau dans le cadre du programme ou du projet de suivi. (Voir example)

occurrence
Bien que ces données puissent être partagées en tant que jeux de données d’occurrence simples, il est préférable qu’ils soient partagés comme des jeux de données d’événement, où l’emplacement, l’identifiant et le contenu de chaque piège peuvent être mieux détaillés.

échantillonnage d’événement
Pièges à insectes (ainsi que d’autres pièges tels que pièges à trappes, les pièges à malaise…) sont généralement utilisés dans les programmes de surveillance pour vérifier la présence (ou l’absence) de certaines espèces et/ou évaluer leur abondance spécifique. L’utilisation du champ « eventID » pour identifier chaque piège permet aux utilisateurs de récupérer tous les spécimens dans chaque piège. La même logique s’applique aux autres protocoles de terrain tels que les transectes, les tracés, les caméras à distance, etc. en utilisant le Noyau d’Evénement au lieu du Noyau d’Occurrence, vous serez en mesure de partager beaucoup plus d’informations sur le contexte de la collecte de données, et permettre aux utilisateurs de mieux comprendre (et même de répliquer) votre travail.

occurrence
enregistrer des individus d’espèces

liste de contrôle
Il est important de savoir combien d’espèces sont présentes dans le périmètre du parc ou de la réserve et leur état de conservation.

échantillonnage d’événement
vérifiez et suivez les populations

occurrence
Les jeux de données Bioblitz sont principalement partagés en tant qu’ensembles de données d’occurrence.

événement d’échantillonnage
Selon le programme scientifique citoyen, des protocoles d’échantillonnage spécifiques peuvent être utilisés par les volontaires, auquel cas les données peuvent être partagées en tant que jeu de données d’événement.

liste de contrôle
Les listes d’espèces géographiques ou thématiques sont souvent utilisées pour partager des informations sur les espèces présentes dans une région donnée ; la plupart du temps, ces listes mentionnent également la répartition de chaque espèce ainsi que son état de conservation dans ce domaine. Les listes d’espèces régionales peuvent donner un aperçu utile de la biodiversité et des habitats d’une région, et doivent être partagés en tant qu’ensembles de données taxonomiques, avec ou sans occurrences associées.