Cours de mobilisation des données sur la biodiversité

occurrence + La plupart du temps, les spécimens des bases de données de collection sont partagés en tant que données d’occurrence. Chaque occurrence (spécimen ou groupe de spécimens) a son propre identifiant unique (parfois dérivé de son numéro de catalogue dans la collection source) et les champs Darwin Core utilisés pour les partager au sein du GBIF décrivent chaque spécimen : nom scientifique, la date à laquelle il a été collectée sur le terrain, qui l’a collecté et/ou identifié, où, etc. Chaque collection peut avoir plus d’un spécimen d’une même espèce, à condition que chaque spécimen soit identifié par un ID unique.

liste d’espèces + Il est également possible de créer et de partager une liste d’espèce taxonomique dérivée d’une base de données de collection ; dans ce cas, il est recommandé de partager la liste de contrôle en tant que jeu de données taxonomiques, avec la liste des occurrences (spécimens) associées à elle en utilisant le Occurrence Core comme extension du Taxon Core sur l’IPT du GBIF.

occurrence + Certains éditeurs de données partageront des ensembles de données d’occurrence provenant d’études ou de programmes de suivi de spécimens provenant de certaines espèces envahissantes spécifiques ; lorsque les données se concentrent sur les individus au lieu de l’espèce envahissante, en général, elles peuvent être partagées en tant que données d’occurrence.

liste d’espèces + Les espèces envahissantes peuvent être suivies et surveillées à différentes échelles (régionales, nationales, thématiques,…); car ce type de jeu de données se concentre davantage sur les espèces et leur distribution sur une portée géographique donnée, ils sont principalement partagés en tant que jeux de données taxonomiques au sein du GBIF (voir les résultats de recherche GRIIS).

occurrence + Les données sont enregistrées par les naturalistes sur le terrain et peuvent être partagées en tant que simples jeux de données d’occurrence.

événement d’échantillonnage + Ils peuvent également être partagés en tant que jeux de données d’événements si des protocoles standardisés (comme des placeaux de végétation, les transects, les pièges, …) sont utilisés pour collecter les données.

occurrence + Ces données sont partagées comme des jeux de données d’occurrences: idéalement, chaque oiseau est identifié avec son organismID et chaque occurrence (GPS ping) a son propre occurrenceID, qui est utile pour suivre les différents emplacements GPS du même oiseau dans le cadre du programme ou du projet de suivi. (Voir example)

occurrence + Bien que ces données puissent être partagées comme de simples ensembles de données d’occurrence, il est préférable qu’elles soient partagées comme des ensembles de données d’événement, où l’emplacement, l’identifiant et le contenu de chaque piège peuvent être mieux détaillés.

événement d’échantillonnage + Pièges d’insectes (ainsi que d’autres pièges comme les pièges à fosses, les pièges à malaise, …) sont généralement utilisés dans les programmes de surveillance pour vérifier la présence (ou l’absence) de certaines espèces et/ou évaluer leur abondance spécifique. L’utilisation du champ « eventID » pour identifier chaque piège permet aux utilisateurs de récupérer tous les spécimens dans chaque piège. La même logique s’applique aux autres protocoles de terrain tels que les transects, les tracés, les caméras à distance, etc. : en utilisant le Event Core au lieu du Occurrence Core, vous serez en mesure de partager beaucoup plus d’informations sur le contexte de la collecte de données, et permettre aux utilisateurs de mieux comprendre (et même de répliquer) votre travail.

occurrence + enregistrement des individus d’une espèce

liste d’espèce + Il est important de savoir combien d’espèces sont présentes dans le périmètre du parc/réserve et leur état de conservation.

événement d’échantillonnage + vérifiez et suivez les populations

occurrence + Les jeux de données Bioblitz sont principalement partagés comme des jeux de données d’occurrence.

événement d’échantillonnage + Selon le programme de science participative, des protocoles d’échantillonnage spécifiques peuvent être utilisés par les volontaires, dans ce cas, les données peuvent être partagées en tant que jeux de données d’événement.

liste d’espèces + Les listes d’espèces géographiques ou thématiques sont souvent utilisées pour partager des informations sur les espèces présentes dans une région donnée ; la plupart du temps, ces listes mentionnent également la répartition de chaque espèce ainsi que son état de conservation dans ce domaine. Les listes d’espèces régionales peuvent donner un aperçu utile de la biodiversité et des habitats d’une région, et doivent être partagées en tant qu’ensembles de données taxonomiques, avec ou sans occurrences associées.