7. Сбор данных
В этом модуле вы узнаете типы первичных данных о биоразнообразии и как наилучшим образом обмениваться этой информацией в рамках GBIF. Вы также рассмотрите принципы качества данных в контексте сбора данных и узнаете о качестве и согласованности данных (особенно по таким вопросам, как географическое распространение, даты, названия и перекрестная таксономическая проверка). |
7.1. Источники и типы данных
В этом видеоролике (10:45) вы рассмотрите https://www.gbif.org/dataset-classes [первичные данные о биоразнообразии ^], которыми можно поделиться в рамках GBIF. Если вы не можете посмотреть встроенное видео, вы можете скачать его по ссылке download. (MP4 - 19 МБ) |
7.1.2. Анализ решений по типам данных
Нажмите, чтобы раскрыть
Какие типы или тип наборов данных вы выберите для ихтиологической коллекции?
-
occurrence (наблюдение) + Почти всегда образцы из коллекционных баз данных передаются в виде данных о наблюдениях. Каждое наблюдение (экземпляр или группа экземпляров) имеет свой собственный уникальный идентификатор (иногда происходящий из его номера в каталоге коллекции), а поля Darwin Core используются для обмена ими в GBIF где описывается каждый экземпляр: научное название, дата сбора, кто собрал и/или идентифицировал его, где и т. д. Каждая коллекция может иметь более одного экземпляра одного вида, до тех пор, пока каждый экземпляра идентифицируется с уникальным кодом.
-
checklist (таксономический список) + Можно также создавать и обмениваться таксономическими списками, полученными из базы данных коллекции; в этом случае рекомендуется поделиться таксономическим списком в качестве таксономического набора данных, с указанием списка наблюдений (экземпляров), связанного с ним, используя ядро Occurrence (Наблюдение) в качестве расширения ядра Taxon (Таксон) на GBIF IPT.
Какие типы или тип наборов данных вы выберите для списка инвазивных видов?
-
occurrence (наблюдение) + Некоторые авторы данных будут обмениваться наборами данных наблюдений, получаемых из исследований или из программ, позволяющих отслеживать экземпляры некоторых инвазивных видов; в таком случае данные сосредоточены на отдельных особях, а не на инвазивных видах, в целом они могут быть переданы по мере поступления данных.
-
checklist (таксономический список) + инвазивные виды могут отслеживаться и контролироваться в различных масштабах (региональном, национальном, тематическом…); поскольку этот тип набора данных больше фокусируется на видах и их распределении в географическом аспекте, они в основном распространяются в рамках GBIF в качестве таксономических наборов данных (https://www.gbif.org/dataset/search?project_id=GRIIS [см. результаты поиска GRIIS]).
Какие типы или тип наборов данных вы выберите для исследования воздействия на окружающую среду?
-
occurrence (наблюдение) + Данные записываются натуралистами в полевых условиях и могут быть переданы как простые наборы данных наблюдений.
-
sampling event (отбор проб) + Они также могут использоваться как наборы данных о событиях отбора проб при стандартизированных протоколах (таких, как участки растительности, трансекты, ловушки…) используемых для сбора данных.
Какие типы или тип наборов данных вы выберите для данных отслеживания перемещений птиц?
-
occurrence (наблюдение) + Эти данные распространяются как наборы данных наблюдений: в идеальном случае, каждая птица идентифицируется по organismID, и каждое наблюдение (GPS пинг) имеет свой собственный occurrenceID, это полезно для отслеживания различных GPS локаций одинаковых птиц в рамках программы слежения или проекта. (Смотри example)
Какие типы или тип наборов данных вы выберите для данных по ловушкам насекомых?
-
occurrence (наблюдение) + Хотя такие данные могут распространены как простые наборы данных наблюдений, лучше всего, если они будут распространяться как наборы данных событий отбора проб, где местоположение, идентификатор и содержимое каждой ловушки могут быть более детализированы.
-
sampling event (отбор проб) + Ловушки для насекомых (а также другие ловушки, такие как ловушки Барбера, ловушки Малеза…), как правило, используются в программах мониторинга для проверки наличия (или отсутствия) некоторых видов и/или оценки их удельного обилия. Использование поля «eventID» для идентификации каждой ловушки позволяет пользователям получить все образцы, собранные в каждой ловушке. Та же логика применима и к другим полевым протоколам, таким как трансекты, графики, удаленные камеры и т. д.: используя ядро Event вместо ядра Occurrence, вы сможете обмениваться гораздо большей информацией о контексте сбора данных и позволять пользователям лучше понимать (и даже воспроизвести) вашу работу.
Какие типы или тип наборов данных вы выберите для данных управления национальным парком?
-
occurrence (наблюдение) + регистрация особей видов
-
checklist (таксономический список) + Важно знать, сколько видов присутствует в парке/охраняемой территории и статусе их охраны.
-
sampling event + проверка и отслеживание популяции
Какие типы или тип наборов данных вы выберите для биоблица гражданской науки?
-
occurrence (наблюдение) + Наборы данных биоблица в основном совместно используются в качестве наборов данных наблюдений.
-
sampling event (отбор проб) + В зависимости от программы гражданской науки добровольцы могут использовать специфические протоколы отбора проб, и в этом случае данные могут распространяться в качестве набора данных о событиях отбора проб.
Какие типы или тип наборов данных вы выберите для регионального списка видов?
-
checklist (таксономический список) + Географические и тематические списки видов часто используются для распространения информации о представленности видов на данных территориях; в большинстве случаев в этих списках упоминается также о распределении каждого вида и статусе их охраны в этой области. Региональные списки видов могут быть полезны для получения представления о биологическом разнообразии и местообитаниях в регионе, и должны быть распространены в виде таксономических наборов данных, с или без связанных наблюдений.
7.2. Сбор данных, их обработка и качество
В этом видео (09:11) вы изучите основы качества данных, относящиеся к их сбору, применительно к извлечению данных из коллекционных этикеток, полевых дневников, электронных таблиц и т.д. Если вы не можете смотреть встроенное видео, вы можете использовать ссылку для его просмотра удаленно download. (MP4 - 19 MB) |